Para obter uma visão ainda melhor de um neurônio, a ferramenta de escolha é um microscópio eletrônico. Embora essa ferramenta pode fornecer deslumbrante close-ups que não podem ser alcançados com microscópios ópticos e de coloração fluorescente, este tipo de imagem tem suas limitações. Retratos da Mente explica que "requer a colocação da amostra em um vácuo de alta, o ambiente de alta radiação, assim que inviabilizariam os estudos em cérebros de viver.
Esta imagem de 2009 revela o corpo da célula principal, ou soma, ou um neurônio espinhoso, com seus dendritos irradiando distância. Para produzir a imagem, um microscópio eletrônico de varredura enviado um feixe de elétrons ao longo da superfície de uma amostra, um detector de seguir o caminho de onde os elétrons saltando para fora da superfície, para revelar os contornos da célula.

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